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Sanford Burnham Prebys 医学发现研究所的最新研究表明，小分子药物的副作用在不同疾病和细胞类型中可能具有治疗潜力。这项突破性研究于 2025 年 11 月 5 日发表在《npj Precision Oncology》期刊上，为药物再利用开辟了新途径。
Sanford Burnham Prebys 癌症代谢和微环境计划的助理教授 Sanju Sinha 博士指出，传统上我们往往以狭隘的视角看待小分子药物，将一些副作用标记为 ’ 脱靶效应 ’。然而，通过更全面的视角，研究人员发现这些药物可能具有不同的靶点和效果，这取决于疾病和细胞类型。
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Sinha 博士开发了一种名为 DeepTarget 的计算工具，用于研究小分子药物的可塑性。该工具不依赖药物的化学结构，而是利用癌细胞中大规模遗传和药物筛选实验的数据。研究团队使用了来自 Dependency Map（DepMap）联盟的 1450 种药物在 371 种癌细胞系中的全面数据。
在八项测试中的七项中，DeepTarget 在预测主要癌症药物靶点方面的表现优于包括 RoseTTAFold All-Atom 和 Chai- 1 在内的当前最先进工具。研究团队还证明，DeepTarget 可以预测药物是否对典型的非突变靶蛋白或其突变形式具有优先作用，并确定药物的次要靶点。
为了验证 DeepTarget 的预测能力，研究团队进行了两项实验案例研究，其中包括 FDA 批准的血液癌症药物 Ibrutinib。研究团队发现，Ibrutinib 通过作用于一种名为表皮生长因子受体（EGFR）的次要靶蛋白来杀死肺癌细胞。
Sinha 博士表示，DeepTool 在现实世界场景中的卓越表现，是因为它更接近地反映了现实世界的药物机制。展望未来，Sinha 博士希望基于团队所学知识，创建新的小分子候选药物，改善癌症及相关甚至更复杂疾病（如衰老）的治疗选择。
该研究由美国国立卫生研究院、美国国家癌症研究所和 Sanford Burnham Prebys 支持。研究团队包括来自 Sanford Burnham Prebys、美国国家癌症研究所和特拉维夫大学的多位科学家。该研究的 DOI 为 10.1038/s41698-025-01111-4。
