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在脑肿瘤治疗领域,脑膜瘤是最常见的原发性颅内肿瘤。放疗是治疗脑膜瘤的常规手段,而制定精准放疗计划的关键,在于对核磁共振(MRI)图像中的靶区进行准确且一致的勾画。然而,这一过程非常复杂、耗时,并且高度依赖临床专家的个人经验,导致不同观察者间的勾画结果可能存在差异。
为了应对这一临床挑战,一个重要的资源应运而生——2024 年脑肿瘤分割挑战脑膜瘤放疗数据集,简称 BraTS-MEN-RT 数据集 。这个数据集是目前规模最大、经过系统标注、专门用于脑膜瘤放疗规划的多机构 MRI 数据集合。
BraTS-MEN-RT 数据集的核心价值
该数据集已经公开,包含了 570 例原始分辨率的放疗规划三维 T1 加权增强 MRI 图像,其中 500 例附有由专家标注的肿瘤大体体积(GTV)。所有标注都严格遵循标准化的放疗规划协议,并同时纳入了完整及术后脑膜瘤病例,确保了数据具有广泛的临床代表性。
尤为重要的是,该数据集的图像资料来自美国和英国的七家不同医疗中心。这种多样化的来源极大地增强了数据集的普适性和研究价值,使得基于此开发的算法更能适应不同机构的设备和成像差异。,
数据集的目标与意义
建立 BraTS-MEN-RT 数据集 的核心目标,是加速放疗计划自动分割算法的研发。通过提供高质量、大规模的标准数据,研究人员可以:,
- 开发和验证更精准的 AI 分割模型。
- 提升临床工作流程的效率,将医生从繁重的手动勾画中解放出来。
- 减少不同观察者间的勾画差异,实现更一致的治疗标准。
- 最终优化脑膜瘤患者的治疗效果和预后。
数据与代码的可用性
为推动科学研究的可重复性和开放性,BraTS-MEN-RT 数据集 的资源已全面公开。
数据可用性:
BraTS-MEN-RT 数据集的图像数据、标签数据及相关临床元数据,已在 Synapse 平台公开提供,访问地址为:https://doi.org/10.7303/syn59059779。
代码可用性:
为遵循科学数据应具备可发现、可访问、可互操作和可重用的原则,本数据集构建过程中所使用的关键工具代码均已开源:,
- 用于将 DICOM-RT 格式转换为 NIfTI 格式的 `dcmrtstruct2nii` 代码库,地址:https://github.com/Sikerdebaard/dcmrtstruct2nii。
- 用于图像去标识化的 AFNI 自动去标识算法,地址:https://github.com/afni/afni。
- 用于初始预分割及迭代再分割的 nnU-Net 模型,地址:https://github.com/ecalabr/nnUNet_models。
- 用于对部分机构提供的 GTV 进行修订的分割修改代码,该代码以 CC-BY 4.0 协议开源,地址:https://github.com/dlabella29/BraTS-MEN-RT_Data_Resource。
总之,BraTS-MEN-RT 数据集 的发布是脑膜瘤精准放疗和 AI 医疗领域的一个重要里程碑。它为全球的研究人员和临床医生提供了一个宝贵的基准平台,有望推动自动分割技术从实验室走向临床,最终惠及广大患者。